Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZNF346Q9UL40 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF346Q9UL40 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF346Q9UL40 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF346Q9UL40 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms