Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNOT11Q9UKZ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CNOT11Q9UKZ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT11Q9UKZ1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT11Q9UKZ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT11Q9UKZ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms