Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKP3

ITGB1BP2, Integrin beta-1-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1BP2Q9UKP3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGB1BP2Q9UKP3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB1BP2Q9UKP3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGB1BP2Q9UKP3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB1BP2Q9UKP3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB1BP2Q9UKP3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB1BP2Q9UKP3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms