Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
TNIKQ9UKE5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TNIKQ9UKE5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
TNIKQ9UKE5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
TNIKQ9UKE5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
TNIKQ9UKE5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
TNIKQ9UKE5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC42.32■■■■■ 4.36
TNIKQ9UKE5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TNIKQ9UKE5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
TNIKQ9UKE5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
TNIKQ9UKE5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
TNIKQ9UKE5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
TNIKQ9UKE5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
TNIKQ9UKE5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
TNIKQ9UKE5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC42.27■■■■■ 4.36
TNIKQ9UKE5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
TNIKQ9UKE5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
TNIKQ9UKE5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TNIKQ9UKE5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TNIKQ9UKE5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TNIKQ9UKE5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
TNIKQ9UKE5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
TNIKQ9UKE5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TNIKQ9UKE5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TNIKQ9UKE5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
TNIKQ9UKE5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
TNIKQ9UKE5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
TNIKQ9UKE5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
TNIKQ9UKE5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
TNIKQ9UKE5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
TNIKQ9UKE5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
TNIKQ9UKE5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
TNIKQ9UKE5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
TNIKQ9UKE5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
TNIKQ9UKE5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
TNIKQ9UKE5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
TNIKQ9UKE5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
TNIKQ9UKE5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
TNIKQ9UKE5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
TNIKQ9UKE5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
TNIKQ9UKE5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
TNIKQ9UKE5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
TNIKQ9UKE5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TNIKQ9UKE5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
TNIKQ9UKE5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC42.12■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
TNIKQ9UKE5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
TNIKQ9UKE5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
TNIKQ9UKE5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
TNIKQ9UKE5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TNIKQ9UKE5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
TNIKQ9UKE5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TNIKQ9UKE5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TNIKQ9UKE5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
TNIKQ9UKE5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
TNIKQ9UKE5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
TNIKQ9UKE5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
TNIKQ9UKE5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TNIKQ9UKE5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
TNIKQ9UKE5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
TNIKQ9UKE5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TNIKQ9UKE5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TNIKQ9UKE5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
TNIKQ9UKE5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
TNIKQ9UKE5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
TNIKQ9UKE5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TNIKQ9UKE5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TNIKQ9UKE5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TNIKQ9UKE5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
TNIKQ9UKE5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
TNIKQ9UKE5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
TNIKQ9UKE5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
TNIKQ9UKE5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
TNIKQ9UKE5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
TNIKQ9UKE5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
TNIKQ9UKE5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
TNIKQ9UKE5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.3
TNIKQ9UKE5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
TNIKQ9UKE5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms