Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NPC1L1Q9UHC9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NPC1L1Q9UHC9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
NPC1L1Q9UHC9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NPC1L1Q9UHC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NPC1L1Q9UHC9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NPC1L1Q9UHC9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NPC1L1Q9UHC9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NPC1L1Q9UHC9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NPC1L1Q9UHC9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NPC1L1Q9UHC9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NPC1L1Q9UHC9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
NPC1L1Q9UHC9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NPC1L1Q9UHC9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NPC1L1Q9UHC9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms