Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MLH3Q9UHC1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MLH3Q9UHC1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MLH3Q9UHC1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MLH3Q9UHC1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
MLH3Q9UHC1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MLH3Q9UHC1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
MLH3Q9UHC1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
MLH3Q9UHC1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
MLH3Q9UHC1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
MLH3Q9UHC1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
MLH3Q9UHC1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
MLH3Q9UHC1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
MLH3Q9UHC1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
MLH3Q9UHC1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
MLH3Q9UHC1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
MLH3Q9UHC1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
MLH3Q9UHC1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
MLH3Q9UHC1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
MLH3Q9UHC1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
MLH3Q9UHC1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
MLH3Q9UHC1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
MLH3Q9UHC1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
MLH3Q9UHC1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
MLH3Q9UHC1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
MLH3Q9UHC1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
MLH3Q9UHC1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
MLH3Q9UHC1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
MLH3Q9UHC1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
MLH3Q9UHC1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
MLH3Q9UHC1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
MLH3Q9UHC1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
MLH3Q9UHC1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
MLH3Q9UHC1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
MLH3Q9UHC1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
MLH3Q9UHC1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
MLH3Q9UHC1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
MLH3Q9UHC1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
MLH3Q9UHC1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
MLH3Q9UHC1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
MLH3Q9UHC1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
MLH3Q9UHC1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
MLH3Q9UHC1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
MLH3Q9UHC1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
MLH3Q9UHC1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
MLH3Q9UHC1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
MLH3Q9UHC1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
MLH3Q9UHC1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
MLH3Q9UHC1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
MLH3Q9UHC1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
MLH3Q9UHC1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
MLH3Q9UHC1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
MLH3Q9UHC1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
MLH3Q9UHC1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
MLH3Q9UHC1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
MLH3Q9UHC1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
MLH3Q9UHC1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
MLH3Q9UHC1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
MLH3Q9UHC1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
MLH3Q9UHC1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
MLH3Q9UHC1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
MLH3Q9UHC1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
MLH3Q9UHC1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
MLH3Q9UHC1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
MLH3Q9UHC1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
MLH3Q9UHC1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
MLH3Q9UHC1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
MLH3Q9UHC1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
MLH3Q9UHC1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
MLH3Q9UHC1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms