Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUX4Q9UBX2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUX4Q9UBX2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUX4Q9UBX2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUX4Q9UBX2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms