Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM8A1Q9UBU6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM8A1Q9UBU6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM8A1Q9UBU6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM8A1Q9UBU6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.9 ms