Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TFIP11Q9UBB9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TFIP11Q9UBB9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TFIP11Q9UBB9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TFIP11Q9UBB9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms