Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP35Q9P2H5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP35Q9P2H5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
USP35Q9P2H5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
USP35Q9P2H5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
USP35Q9P2H5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
USP35Q9P2H5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
USP35Q9P2H5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
USP35Q9P2H5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP35Q9P2H5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP35Q9P2H5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP35Q9P2H5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
USP35Q9P2H5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
USP35Q9P2H5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
USP35Q9P2H5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP35Q9P2H5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
USP35Q9P2H5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
USP35Q9P2H5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms