Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0I2

EMC3, ER membrane protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC3Q9P0I2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC3Q9P0I2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMC3Q9P0I2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMC3Q9P0I2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMC3Q9P0I2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMC3Q9P0I2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms