Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMOD4Q9NZQ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD4Q9NZQ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD4Q9NZQ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD4Q9NZQ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TMOD4Q9NZQ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMOD4Q9NZQ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMOD4Q9NZQ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMOD4Q9NZQ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMOD4Q9NZQ9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD4Q9NZQ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD4Q9NZQ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMOD4Q9NZQ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMOD4Q9NZQ9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMOD4Q9NZQ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TMOD4Q9NZQ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMOD4Q9NZQ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TMOD4Q9NZQ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMOD4Q9NZQ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMOD4Q9NZQ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD4Q9NZQ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD4Q9NZQ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMOD4Q9NZQ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMOD4Q9NZQ9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMOD4Q9NZQ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMOD4Q9NZQ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TMOD4Q9NZQ9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMOD4Q9NZQ9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMOD4Q9NZQ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMOD4Q9NZQ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMOD4Q9NZQ9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMOD4Q9NZQ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMOD4Q9NZQ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMOD4Q9NZQ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMOD4Q9NZQ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD4Q9NZQ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TMOD4Q9NZQ9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMOD4Q9NZQ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMOD4Q9NZQ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMOD4Q9NZQ9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMOD4Q9NZQ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TMOD4Q9NZQ9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
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