Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH8Q9NYR8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RDH8Q9NYR8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RDH8Q9NYR8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms