Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KCND1Q9NSA2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KCND1Q9NSA2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCND1Q9NSA2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCND1Q9NSA2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCND1Q9NSA2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms