Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO1B3Q9NPD5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO1B3Q9NPD5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO1B3Q9NPD5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLCO1B3Q9NPD5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms