Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BPIFA1Q9NP55 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BPIFA1Q9NP55 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BPIFA1Q9NP55 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BPIFA1Q9NP55 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPIFA1Q9NP55 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPIFA1Q9NP55 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BPIFA1Q9NP55 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BPIFA1Q9NP55 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPIFA1Q9NP55 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPIFA1Q9NP55 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPIFA1Q9NP55 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BPIFA1Q9NP55 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA1Q9NP55 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA1Q9NP55 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA1Q9NP55 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA1Q9NP55 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA1Q9NP55 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BPIFA1Q9NP55 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms