Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TNRC6CQ9HCJ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRC6CQ9HCJ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TNRC6CQ9HCJ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNRC6CQ9HCJ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNRC6CQ9HCJ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNRC6CQ9HCJ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNRC6CQ9HCJ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNRC6CQ9HCJ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNRC6CQ9HCJ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNRC6CQ9HCJ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNRC6CQ9HCJ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TNRC6CQ9HCJ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNRC6CQ9HCJ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms