Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CLSPNQ9HAW4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CLSPNQ9HAW4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CLSPNQ9HAW4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
CLSPNQ9HAW4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CLSPNQ9HAW4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
CLSPNQ9HAW4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
CLSPNQ9HAW4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
CLSPNQ9HAW4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CLSPNQ9HAW4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
CLSPNQ9HAW4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CLSPNQ9HAW4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CLSPNQ9HAW4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CLSPNQ9HAW4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CLSPNQ9HAW4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CLSPNQ9HAW4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CLSPNQ9HAW4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CLSPNQ9HAW4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CLSPNQ9HAW4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CLSPNQ9HAW4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CLSPNQ9HAW4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CLSPNQ9HAW4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CLSPNQ9HAW4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CLSPNQ9HAW4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CLSPNQ9HAW4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CLSPNQ9HAW4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
CLSPNQ9HAW4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CLSPNQ9HAW4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CLSPNQ9HAW4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CLSPNQ9HAW4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CLSPNQ9HAW4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CLSPNQ9HAW4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
CLSPNQ9HAW4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CLSPNQ9HAW4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CLSPNQ9HAW4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CLSPNQ9HAW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CLSPNQ9HAW4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CLSPNQ9HAW4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CLSPNQ9HAW4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CLSPNQ9HAW4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CLSPNQ9HAW4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CLSPNQ9HAW4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CLSPNQ9HAW4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CLSPNQ9HAW4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CLSPNQ9HAW4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLSPNQ9HAW4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLSPNQ9HAW4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CLSPNQ9HAW4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CLSPNQ9HAW4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 433.4 ms