Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA72

CALHM2, Calcium homeostasis modulator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALHM2Q9HA72 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALHM2Q9HA72 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CALHM2Q9HA72 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CALHM2Q9HA72 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALHM2Q9HA72 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALHM2Q9HA72 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALHM2Q9HA72 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALHM2Q9HA72 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALHM2Q9HA72 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALHM2Q9HA72 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALHM2Q9HA72 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALHM2Q9HA72 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALHM2Q9HA72 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALHM2Q9HA72 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALHM2Q9HA72 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALHM2Q9HA72 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALHM2Q9HA72 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms