Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NANOGQ9H9S0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NANOGQ9H9S0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NANOGQ9H9S0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NANOGQ9H9S0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms