Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J7

SLC6A15, Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT2, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A15Q9H2J7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A15Q9H2J7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A15Q9H2J7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A15Q9H2J7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A15Q9H2J7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A15Q9H2J7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A15Q9H2J7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A15Q9H2J7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A15Q9H2J7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms