Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A4Q9H015 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC22A4Q9H015 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A4Q9H015 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms