Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4CQ9C0C4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4CQ9C0C4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4CQ9C0C4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4CQ9C0C4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA4CQ9C0C4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4CQ9C0C4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms