Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YTHDF1Q9BYJ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDF1Q9BYJ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
YTHDF1Q9BYJ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDF1Q9BYJ9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms