Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC94Q9BW85 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC94Q9BW85 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC94Q9BW85 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC94Q9BW85 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC94Q9BW85 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC94Q9BW85 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC94Q9BW85 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC94Q9BW85 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC94Q9BW85 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC94Q9BW85 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC94Q9BW85 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC94Q9BW85 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC94Q9BW85 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC94Q9BW85 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms