Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MKNK1Q9BUB5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MKNK1Q9BUB5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MKNK1Q9BUB5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MKNK1Q9BUB5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms