Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM208Q9BTX3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM208Q9BTX3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM208Q9BTX3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM208Q9BTX3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM208Q9BTX3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM208Q9BTX3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM208Q9BTX3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM208Q9BTX3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMEM208Q9BTX3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM208Q9BTX3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM208Q9BTX3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM208Q9BTX3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMEM208Q9BTX3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM208Q9BTX3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM208Q9BTX3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM208Q9BTX3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms