Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3CQ99985 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SEMA3CQ99985 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3CQ99985 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3CQ99985 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA3CQ99985 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms