Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLCC1Q96S66 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLCC1Q96S66 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLCC1Q96S66 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms