Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCCC1Q96RQ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCCC1Q96RQ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCC1Q96RQ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCC1Q96RQ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCC1Q96RQ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCC1Q96RQ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCCC1Q96RQ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MCCC1Q96RQ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCCC1Q96RQ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCCC1Q96RQ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.9 ms