Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMG1Q96Q15 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMG1Q96Q15 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG1Q96Q15 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMG1Q96Q15 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG1Q96Q15 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
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