Protein–RNA interactions for Protein: Q96PZ7

CSMD1, CUB and sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD1Q96PZ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSMD1Q96PZ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSMD1Q96PZ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSMD1Q96PZ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSMD1Q96PZ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSMD1Q96PZ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSMD1Q96PZ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSMD1Q96PZ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSMD1Q96PZ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSMD1Q96PZ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSMD1Q96PZ7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSMD1Q96PZ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSMD1Q96PZ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms