Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCLT1Q96NL6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCLT1Q96NL6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCLT1Q96NL6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCLT1Q96NL6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCLT1Q96NL6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCLT1Q96NL6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCLT1Q96NL6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCLT1Q96NL6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SCLT1Q96NL6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SCLT1Q96NL6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCLT1Q96NL6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms