Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00208Q96KT6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00208Q96KT6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00208Q96KT6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms