Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VCPIP1Q96JH7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VCPIP1Q96JH7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
VCPIP1Q96JH7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VCPIP1Q96JH7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms