Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM4SF19Q96DZ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM4SF19Q96DZ7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TM4SF19Q96DZ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TM4SF19Q96DZ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF19Q96DZ7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF19Q96DZ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF19Q96DZ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM4SF19Q96DZ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms