Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PABPC5Q96DU9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PABPC5Q96DU9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PABPC5Q96DU9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PABPC5Q96DU9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PABPC5Q96DU9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PABPC5Q96DU9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PABPC5Q96DU9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PABPC5Q96DU9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PABPC5Q96DU9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PABPC5Q96DU9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PABPC5Q96DU9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PABPC5Q96DU9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PABPC5Q96DU9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PABPC5Q96DU9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PABPC5Q96DU9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PABPC5Q96DU9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PABPC5Q96DU9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PABPC5Q96DU9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC5Q96DU9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms