Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPRTQ96BW1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPRTQ96BW1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPRTQ96BW1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UPRTQ96BW1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPRTQ96BW1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPRTQ96BW1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
UPRTQ96BW1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPRTQ96BW1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPRTQ96BW1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPRTQ96BW1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPRTQ96BW1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UPRTQ96BW1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPRTQ96BW1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms