Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC35C1Q96A29 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC35C1Q96A29 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC35C1Q96A29 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC35C1Q96A29 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC35C1Q96A29 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms