Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTSSAQ969W0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTSSAQ969W0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPTSSAQ969W0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTSSAQ969W0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms