Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCLNQ969V3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLNQ969V3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCLNQ969V3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLNQ969V3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLNQ969V3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCLNQ969V3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLNQ969V3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLNQ969V3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCLNQ969V3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLNQ969V3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLNQ969V3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLNQ969V3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCLNQ969V3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCLNQ969V3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCLNQ969V3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCLNQ969V3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCLNQ969V3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms