Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG4AQ8WYN0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ATG4AQ8WYN0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG4AQ8WYN0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG4AQ8WYN0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG4AQ8WYN0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms