Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ7

ABCA5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA5Q8WWZ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
ABCA5Q8WWZ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC43.32■■■■■ 4.52
ABCA5Q8WWZ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
ABCA5Q8WWZ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
ABCA5Q8WWZ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
ABCA5Q8WWZ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
ABCA5Q8WWZ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
ABCA5Q8WWZ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
ABCA5Q8WWZ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
ABCA5Q8WWZ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
ABCA5Q8WWZ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
ABCA5Q8WWZ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
ABCA5Q8WWZ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
ABCA5Q8WWZ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ABCA5Q8WWZ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCA5Q8WWZ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCA5Q8WWZ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
ABCA5Q8WWZ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ABCA5Q8WWZ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
ABCA5Q8WWZ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ABCA5Q8WWZ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ABCA5Q8WWZ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ABCA5Q8WWZ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.19■■■■■ 4.51
ABCA5Q8WWZ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
ABCA5Q8WWZ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
ABCA5Q8WWZ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ABCA5Q8WWZ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ABCA5Q8WWZ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ABCA5Q8WWZ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCA5Q8WWZ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.16■■■■■ 4.5
ABCA5Q8WWZ7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
ABCA5Q8WWZ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
ABCA5Q8WWZ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
ABCA5Q8WWZ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
ABCA5Q8WWZ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
ABCA5Q8WWZ7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.49
ABCA5Q8WWZ7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
ABCA5Q8WWZ7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
ABCA5Q8WWZ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCA5Q8WWZ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCA5Q8WWZ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
ABCA5Q8WWZ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCA5Q8WWZ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCA5Q8WWZ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
ABCA5Q8WWZ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
ABCA5Q8WWZ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
ABCA5Q8WWZ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
ABCA5Q8WWZ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
ABCA5Q8WWZ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ABCA5Q8WWZ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ABCA5Q8WWZ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
ABCA5Q8WWZ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
ABCA5Q8WWZ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
ABCA5Q8WWZ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
ABCA5Q8WWZ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ABCA5Q8WWZ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ABCA5Q8WWZ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
ABCA5Q8WWZ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
ABCA5Q8WWZ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
ABCA5Q8WWZ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ABCA5Q8WWZ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
ABCA5Q8WWZ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
ABCA5Q8WWZ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCA5Q8WWZ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms