Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHTF18Q8WVB6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHTF18Q8WVB6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHTF18Q8WVB6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHTF18Q8WVB6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHTF18Q8WVB6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHTF18Q8WVB6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHTF18Q8WVB6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHTF18Q8WVB6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHTF18Q8WVB6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHTF18Q8WVB6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHTF18Q8WVB6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHTF18Q8WVB6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHTF18Q8WVB6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHTF18Q8WVB6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHTF18Q8WVB6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHTF18Q8WVB6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHTF18Q8WVB6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHTF18Q8WVB6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHTF18Q8WVB6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHTF18Q8WVB6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHTF18Q8WVB6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHTF18Q8WVB6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHTF18Q8WVB6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms