Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS2

GOT1L1, Putative aspartate aminotransferase, cytoplasmic 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1L1Q8NHS2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOT1L1Q8NHS2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOT1L1Q8NHS2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOT1L1Q8NHS2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GOT1L1Q8NHS2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOT1L1Q8NHS2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOT1L1Q8NHS2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOT1L1Q8NHS2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOT1L1Q8NHS2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GOT1L1Q8NHS2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOT1L1Q8NHS2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GOT1L1Q8NHS2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms