Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDCL2Q8N4E4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDCL2Q8N4E4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDCL2Q8N4E4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDCL2Q8N4E4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDCL2Q8N4E4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms