Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D3Q8IZS8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CACNA2D3Q8IZS8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CACNA2D3Q8IZS8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA2D3Q8IZS8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA2D3Q8IZS8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms