Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM139Q8IV31 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM139Q8IV31 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM139Q8IV31 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM139Q8IV31 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM139Q8IV31 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM139Q8IV31 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM139Q8IV31 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM139Q8IV31 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM139Q8IV31 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM139Q8IV31 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms