Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF554Q86TJ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF554Q86TJ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF554Q86TJ5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms