Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HCC1LQ7Z5L2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HCC1LQ7Z5L2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3HCC1LQ7Z5L2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1LQ7Z5L2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1LQ7Z5L2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1LQ7Z5L2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1LQ7Z5L2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3HCC1LQ7Z5L2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
R3HCC1LQ7Z5L2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
R3HCC1LQ7Z5L2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
R3HCC1LQ7Z5L2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3HCC1LQ7Z5L2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3HCC1LQ7Z5L2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
R3HCC1LQ7Z5L2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms